RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 BDKRB1P46663 353 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PREPP48147 710 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CRYBA2P53672 197 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CSNK2BP67870 215 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 OCA2Q04671 838 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF805Q5CZA5 627 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 YIPF6Q96EC8 236 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TDP1Q9NUW8 608 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 IL36AQ9UHA7 158 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ERGIC3Q9Y282 383 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TTC34A8MYJ7 566 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 J3QRK9 145 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RGS10O43665 173 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NPRL3Q12980 569 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 HKDC1Q2TB90 917 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MED27Q6P2C8 311 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NRSN1Q8IZ57 195 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 VMP1Q96GC9 406 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TPD52L3Q96J77 140 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DOHHQ9BU89 302 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 GABARAPL3Q9BY60 117 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 RNF208Q9H0X6 261 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.72□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CLDN25C9JDP6 229 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SULT1C4O75897 302 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 CTSLP07711 333 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NUDT7P0C024 238 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 MMP12P39900 470 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 PHEXP78562 749 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 GAB1Q13480 694 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF846Q147U1 533 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 NAT16Q8N8M0 369 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 WDR34Q96EX3 536 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.71□□□□□ -0.05
HDAC5-211ENST00000592385 SOBPA7XYQ1 873 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 PCDH7O60245 1069 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MT-ND2P03891 347 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OCM2P0CE71 109 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NR4A1P22736 598 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CLCA4Q14CN2 919 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TEAD2Q15562 447 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MYLIPQ8WY64 445 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FOXJ1Q92949 421 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NEIL2Q969S2 332 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 AP2M1Q96CW1 435 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 HMG20AQ9NP66 347 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MARK1Q9P0L2 795 aa14.71□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF197O14709 1029 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FAM20BO75063 409 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MOSPD3O75425 235 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ELFN1P0C7U0 828 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 FSHRP23945 695 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 EPHA2P29317 976 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 OPRL1P41146 370 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MAP2K4P45985 399 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 MASP1P48740 699 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF77Q15935 545 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 RGS21Q2M5E4 152 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 LIPIQ6XZB0 460 aa14.7□□□□□ -0.06
HDAC5-211ENST00000592385 NLRP8Q86W28 1048 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms