RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 NXPE1Q8N323 547 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CLDN19Q8N6F1 224 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR13F1Q8NGS4 319 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM203Q969S6 136 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 FERD3LQ96RJ6 166 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 FAM129BQ96TA1 746 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 C12orf4Q9NQ89 552 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CLEC4AQ9UMR7 237 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ARL6IP5O75915 188 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 HLA-DQA2P01906 255 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ITGAMP11215 1152 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 KELP23276 732 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CCR4P51679 360 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 RHAGQ02094 409 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF33BQ06732 778 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF763Q0D2J5 394 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SPHARQ15513 63 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF783Q6ZMS7 281 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TTLQ8NG68 377 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR10H4Q8NGA5 316 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PIP5K1AQ99755 562 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM36Q9NQ86 728 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 C14orf105Q9NVL8 296 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MAT2BQ9NZL9 334 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 USP54Q70EL1 1684 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ISM1B1AKI9 464 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR10H2O60403 315 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ITGA10O75578 1167 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ALPPP05187 535 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ADH1AP07327 375 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 14.3
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TMC8Q8IU68 726 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 DCAF4L2Q8NA75 395 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MGME1Q9BQP7 344 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CORO1BQ9BR76 489 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 IFT52Q9Y366 437 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MAST2Q6P0Q8 1798 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR14I1A6ND48 311 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ALPIP09923 528 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 IFI30P13284 250 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MATN1P21941 496 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SLC36A4Q6YBV0 504 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR52B6Q8NGF0 335 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 PTERQ96BW5 349 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 C16orf70Q9BSU1 422 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TTLL2Q9BWV7 592 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SLA2Q9H6Q3 261 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 EQTNQ9NQ60 294 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 HCN2Q9UL51 889 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 AGAP5A6NIR3 686 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 FAAHO00519 579 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 AGR2O95994 175 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 STSP08842 583 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF30P17039 623 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 CSKP41240 450 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 TAS2R43P59537 309 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 REEP4Q9H6H4 257 aa10.04□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 SOCS5O75159 536 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 OR2B3O76000 313 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 MAGEA12P43365 314 aa10.03□□□□□ -0.8
PTPRM-205ENST00000577827 ARFIP1P53367 373 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms