RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 IDSB3KWA1 339 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 H0YIG0 161 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 NSA2O95478 260 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 ITGA3P26006 1051 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 PHBP35232 272 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 MYBPC3Q14896 1274 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 NADK2Q4G0N4 442 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 NXPE4Q6UWF7 544 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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CMTM4-204ENST00000563952 C8orf44Q96CB5 159 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 MOCOSQ96EN8 888 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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CMTM4-204ENST00000563952 ANKHQ9HCJ1 492 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 WWOXQ9NZC7 414 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 HCN3Q9P1Z3 774 aa29.15■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 SGK494L7N484 410 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 MAP2K7O14733 419 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 HEXBP07686 556 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 ACPPP15309 386 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 REEP5Q00765 189 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 FAAH2Q6GMR7 532 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 EXT2Q93063 718 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 UBXN10Q96LJ8 280 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 AIF1LQ9BQI0 150 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 MFRPQ9BY79 579 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 TGIF2Q9GZN2 237 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 SCN3AQ9NY46 2000 aa29.14■■■□□ 2.26
CMTM4-204ENST00000563952 DPM1O60762 260 aa29.13■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 CRABP2P29373 138 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 SLC6A12P48065 614 aa29.13■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 FBXO48Q5FWF7 155 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 TCAIMQ8N3R3 496 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 CYTH2Q99418 400 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 FMO2Q99518 471 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 CD274Q9NZQ7 290 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 RNF112Q9ULX5 631 aa29.13■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ALPPP05187 535 aa29.12■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 KIAA1191Q96A73 305 aa29.12■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM79Q9BSE2 394 aa29.12■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 TSPYL1Q9H0U9 437 aa29.12■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 ALG9Q9H6U8 611 aa29.12■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ZFP69BQ9UJL9 534 aa29.12■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 KLHL41O60662 606 aa29.11■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 S100BP04271 92 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 ATG9BQ674R7 924 aa29.11■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 HPS6Q86YV9 775 aa29.11■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 TFEBP19484 476 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 AHRP35869 848 aa29.1■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 CSRP3P50461 194 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 MLLT10P55197 1068 aa29.1■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 CDC16Q13042 620 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 SULT1C3Q6IMI6 304 aa29.1■■■□□ 2.25
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