RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	IDS	P22304	550 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	IDUA	P35475	653 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ETV3	P41162	512 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM16L	Q309B1	348 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	OR4K3	Q96R72	315 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CORO1B	Q9BR76	489 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	17.75	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FSHR	P23945	695 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	17.74	■□□□□ 0.43	4e-8	■■■■□ 24.4
RRN3-205	ENST00000563559	KRT20	P35900	424 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NNMT	P40261	264 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MASP1	P48740	699 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PRLHR	P49683	370 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD7	P51665	324 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FADD	Q13158	208 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	E2F2	Q14209	437 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ADCK1	Q86TW2	530 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TOX2	Q96NM4	488 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PLXNA2	O75051	1894 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN24	A6NM45	220 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MAN1A2	O60476	641 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	LEFTY1	O75610	366 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SLC16A8	O95907	504 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FUCA1	P04066	466 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CTSA	P10619	480 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	IMPA1	P29218	277 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOW	P63302	87 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	HKDC1	Q2TB90	917 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MED27	Q6P2C8	311 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	P3H2	Q8IVL5	708 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	IRF7	Q92985	503 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GLYATL1	Q969I3	302 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ZBP1	Q9H171	429 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		17.74	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM202	A6NGA9	273 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ETHE1	O95571	254 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TIMP2	P16035	220 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CDH3	P22223	829 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	EPHA2	P29317	976 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RELA	Q04206	551 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TLE2	Q04725	743 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RBBP4	Q09028	425 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	DGCR6	Q14129	220 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	LILRA6	Q6PI73	481 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NDNF	Q8TB73	568 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MRO	Q9BYG7	248 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF1	Q9NS23	344 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GIN1	Q9NXP7	522 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	AASS	Q9UDR5	926 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	CCL26	Q9Y258	94 aa		17.73	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH7	O60245	1069 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA12	O60330	932 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT7	P0C024	238 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	TYR	P14679	529 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	17.72	■□□□□ 0.43	5e-7	■■□□□ 11.4
RRN3-205	ENST00000563559	RRM2	P31350	389 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ELP6	Q0PNE2	266 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	MLIP	Q5VWP3	458 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	DPPA4	Q7L190	304 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	PKP4	Q99569	1192 aa		17.72	■□□□□ 0.43
RRN3-205	ENST00000563559	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	17.72	■□□□□ 0.43

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