RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 KCT2Q8NC54 265 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 C8orf44Q96CB5 159 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 LHPPQ9H008 270 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SLC22A7Q9Y694 548 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ESYT3A0FGR9 886 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 BMP10O95393 424 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 CYC1P08574 325 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC166P0CW27 439 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 COX6A1P12074 109 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SCTRP47872 440 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ATP6V0D1P61421 351 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 GUCY2DQ02846 1103 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 PWP1Q13610 501 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 TGFBIQ15582 683 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM205Q6UW68 189 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ATCAYQ86WG3 371 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 PPM1NQ8N819 430 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 NT5CQ8TCD5 201 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 FBF1Q8TES7 1133 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 TSNARE1Q96NA8 513 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 AGAP4Q96P64 663 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF160Q9HCG1 818 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SGK494L7N484 410 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFS4O43181 175 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 CD1DP15813 335 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 AHRP35869 848 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SLC6A12P48065 614 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 RAB10P61026 200 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 Q0VFX4 171 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 HERC3Q15034 1050 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 CDKL4Q5MAI5 379 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXD8-204ENST00000544999 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 FAM155BO75949 473 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 KLHL18O94889 574 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 WDR47O94967 919 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TUBB4AP04350 444 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 XCR1P46094 333 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 RGS1Q08116 209 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 Q6ZS92 163 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PDSS2Q86YH6 399 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 KBTBD2Q8IY47 623 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA6LQ8N4H0 392 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 MMGT1Q8N4V1 131 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 TRPV3Q8NET8 790 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF592Q92610 1267 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 UBXN10Q96LJ8 280 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 RIC8BQ9NVN3 520 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 LUZP4Q9P127 313 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 VPS4BO75351 444 aa16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 RDH16O75452 317 aa16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 JRKO75564 520 aa16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 SERPIND1P05546 499 aa16■□□□□ 0.15
HOXD8-204ENST00000544999 C8orf89P0DMQ9 161 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms