RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541295.5

LMO3-225, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 3,498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-225ENST00000541295 OR10H4Q8NGA5 316 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 OR5D18Q8NGL1 313 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 MITD1Q8WV92 249 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 AP3S1Q92572 193 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 MEGF10Q96KG7 1140 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 RNF32Q9H0A6 362 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 UBE4BO95155 1302 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CBY3A6NI87 242 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 BTN3A3O00478 584 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CTDSP2O14595 271 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PRRG1O14668 218 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GPR182O15218 404 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PRODHO43272 600 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SPINT1O43278 529 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SIGLEC6O43699 453 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SNAP91O60641 907 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ETS1P14921 441 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 NQO2P16083 231 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 DGKAP23743 735 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GPR15P49685 360 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CYP2J2P51589 502 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 RAD23AP54725 363 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTBP60709 375 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTA2P62736 377 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTG1P63261 375 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTG2P63267 376 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTC1P68032 377 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACTA1P68133 377 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 POU4F2Q12837 409 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GAS6Q14393 721 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SLC9A3R2Q15599 337 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TRAM1Q15629 374 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GRK1Q15835 563 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ATP6AP1Q15904 470 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 NHSL2Q5HYW2 709 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PADI6Q6TGC4 694 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CREB3L2Q70SY1 520 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 LIX1LQ8IVB5 337 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TSPAN14Q8NG11 270 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 C12orf42Q96LP6 360 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 RNF145Q96MT1 663 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
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LMO3-225ENST00000541295 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ASB7Q9H672 318 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SRPK3Q9UPE1 567 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 ADGRG1Q9Y653 693 aa6□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SLC30A4O14863 429 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GYG2O15488 501 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PLIN3O60664 434 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 SLC22A5O76082 557 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 FPR3P25089 353 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 GIFP27352 417 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 FOXN2P32314 431 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 HPCAL1P37235 193 aa5.99□□□□□ -1.45
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LMO3-225ENST00000541295 TSPAN31Q12999 210 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 BIKQ13323 160 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 HNF4GQ14541 408 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 MAN2A1Q16706 1144 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 FAM187BQ17R55 369 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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LMO3-225ENST00000541295 P4HA3Q7Z4N8 544 aa5.99□□□□□ -1.45
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LMO3-225ENST00000541295 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
LMO3-225ENST00000541295 FITM2Q8N6M3 262 aa5.99□□□□□ -1.45
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