RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 NIPAL1Q6NVV3 410 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 VN1R4Q7Z5H5 301 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TRIM42Q8IWZ5 723 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF740Q8NDX6 193 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SLC13A3Q8WWT9 602 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 LRFN5Q96NI6 719 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CTRCQ99895 268 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 MECRQ9BV79 373 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PMS2P1A4D2B8 440 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC3AO75596 197 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ESRRBO95718 433 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SLC5A2P31639 672 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R2AP63151 447 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SKP1P63208 163 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FOXK2Q01167 660 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 MUM1Q2TAK8 710 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PRTGQ2VWP7 1150 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RHBDD2Q6NTF9 364 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 KIRREL3Q8IZU9 778 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 OR4N4Q8N0Y3 316 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 OR4F6Q8NGB9 312 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 NT5CQ8TCD5 201 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PROKR1Q8TCW9 393 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 MVB12AQ96EY5 273 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FER1L5A0AVI2 2057 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM114B3SHH9 223 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 STMND1H3BQB6 276 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFS4O43181 175 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINE1P05121 402 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SERPINA6P08185 405 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 NEFHP12036 1026 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PIK3CBP42338 1070 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF33BQ06732 778 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RCN2Q14257 317 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 OR7G3Q8NG95 312 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 AGAP11Q8TF27 550 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PPT2Q9UMR5 302 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SNX6Q9UNH7 406 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF749O43361 778 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 STK17BO94768 372 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 GCGRP47871 477 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 OR6Y1Q8NGX8 325 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PMEPA1Q969W9 287 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 MID1IP1Q9NPA3 183 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CUTCQ9NTM9 273 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FOXJ2Q9P0K8 574 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 RNF11Q9Y3C5 154 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1B0GX78 115 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 HYKKA2RU49 373 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 KIAA0754O94854 1291 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 DLGAP3O95886 979 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRT6AP02538 564 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRT6BP04259 564 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 NR1D1P20393 614 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 KRT6CP48668 564 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 IFT88Q13099 833 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FAM53BQ14153 422 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FRG2Q64ET8 278 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 LETMD1Q6P1Q0 360 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CDK15Q96Q40 435 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FRG2BQ96QU4 278 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 CENPKQ9BS16 269 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 FAM117AQ9C073 453 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 PSD3Q9NYI0 1048 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 SLC22A7Q9Y694 548 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRK-218ENST00000525459 DSCR3O14972 297 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 OR4F21O95013 312 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 TIAF1O95411 115 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 PCNAP12004 261 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 TSPAN8P19075 237 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRK-218ENST00000525459 HMOX2P30519 316 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms