RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	EXT2	Q93063	718 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ALG14	Q96F25	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CNIH4	Q9P003	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LRP4	O75096	1905 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC16A	O15027	2179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TTC26	A0AVF1	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636		B5MCH6	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636		E7EVH7	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NDUFS8	O00217	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PIR	O00625	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PJA2	O43164	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC37A4	O43826	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CIDEA	O60543	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GCAT	O75600	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ONECUT2	O95948	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MMP2	P08253	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYC1	P08574	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	STS	P08842	583 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INHBB	P09529	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CXCL8	P10145	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANXA8	P13928	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SELL	P14151	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DDC	P20711	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SAT1	P21673	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP3A7	P24462	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MCM3	P25205	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PTPN7	P35236	360 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DRD3	P35462	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BSG	P35613	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRKCI	P41743	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HAAO	P46952	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BLVRA	P53004	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRRX1	P54821	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CTXN1	P60606	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PRAME	P78395	509 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	OVGP1	Q12889	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MTM1	Q13496	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DPYS	Q14117	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GRM7	Q14831	915 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PCLAF	Q15004	111 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RCN1	Q15293	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DOK3	Q7L591	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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