RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 NR1D1P20393 614 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 GRK2P25098 689 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 RCN2Q14257 317 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CAMKVQ8NCB2 501 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 OR7G3Q8NG95 312 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MDM1Q8TC05 714 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MGARPQ8TDB4 240 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 REPS1Q96D71 796 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 NLNQ9BYT8 704 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SPEGQ15772 3267 aa20.2■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM114B3SHH9 223 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 P2RX6O15547 441 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SCRG1O75711 98 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TIAF1O95411 115 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SERPINA6P08185 405 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CD82P27701 267 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 PIK3CBP42338 1070 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CCR10P46092 362 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CHI3L2Q15782 390 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 HOMEZQ8IX15 550 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 PPT2Q9UMR5 302 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SRPK3Q9UPE1 567 aa20.19■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 BRINP1O60477 761 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 OR4F21O95013 312 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 HBQ1P09105 142 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CHN1P15882 459 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLC5A2P31639 672 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARSFP54793 590 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CES4AQ5XG92 561 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM126BQ8IUX1 230 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 LRFN5Q96NI6 719 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 THSD1Q9NS62 852 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 AK5Q9Y6K8 562 aa20.18■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 HYKKA2RU49 373 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 NDUFS4O43181 175 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF749O43361 778 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 DLGAP3O95886 979 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CAPN1P07384 714 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 BGNP21810 368 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARRB2P32121 409 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF33BQ06732 778 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 RGS1Q08116 209 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 HYAL2Q12891 473 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 HKDC1Q2TB90 917 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FRG2Q64ET8 278 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 RHBDD2Q6NTF9 364 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CUZD1Q86UP6 607 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FRG2BQ96QU4 278 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 STARD5Q9NSY2 213 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 IRAK4Q9NWZ3 460 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 SNX6Q9UNH7 406 aa20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 KLF11O14901 512 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 CHRNGP07510 517 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 FGF4P08620 206 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF28P17035 718 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms