RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	RGS4	P49798	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24	6e-7	■□□□□ 10.1
RBM4-208	ENST00000510173	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	HAT1	O14929	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	FOXS1	O43638	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TTC4	O95801	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	PGAM1	P18669	254 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	GRK3	P35626	688 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SLC1A2	P43004	574 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SP140	Q13342	867 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MTFR2	Q6P444	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CD200R1	Q8TD46	325 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	PSMF1	Q92530	271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	NR4A3	Q92570	626 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC138	Q96M89	665 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	RUBCNL	Q9H714	662 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	GALP	Q9UBC7	116 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	C8G	P07360	202 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	COL8A1	P27658	744 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	IMPA1	P29218	277 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	AGTR2	P50052	363 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	TBPL1	P62380	186 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SKP1	P63208	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	RBPJ	Q06330	500 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CTBP1	Q13363	440 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	HDX	Q7Z353	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	C17orf64	Q86WR6	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	GPR21	Q99679	349 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	CREBBP	Q92793	2442 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RBM4-208	ENST00000510173	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173		H7BY64	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	FFAR3	O14843	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	SLC16A5	O15375	505 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	GPR42	O15529	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	P2RX6	O15547	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	BANF1	O75531	89 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	RASAL1	O95294	804 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	MLYCD	O95822	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ABHD2	P08910	425 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	HIST1H2AD	P20671	130 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	IL10	P22301	178 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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