RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ANKRD53Q8N9V6 530 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TTLQ8NG68 377 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 OR10G6Q8NH81 332 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 FCRL1Q96LA6 429 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 RHBGQ9H310 441 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 POT1Q9NUX5 634 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 B4DGG1 531 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 WNT1P04628 370 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 KLK1P06870 262 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 HPCAL1P37235 193 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 MS4A2Q01362 244 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 BIRC2Q13490 618 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CCNIQ14094 377 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ELOCQ15369 112 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 RABL3Q5HYI8 236 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 IQCHQ86VS3 1027 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 SPATA24Q86W54 205 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ANKRD46Q86W74 232 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 FBXL6Q8N531 539 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 OR7A2PQ8NGA2 310 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ZFPM2Q8WW38 1151 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 GTF2H4Q92759 462 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ITCHQ96J02 903 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 LRGUKQ96M69 825 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM74Q96NL1 305 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CGREF1Q99674 301 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 IER2Q9BTL4 223 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 LRRC61Q9BV99 259 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NT5DC2Q9H857 520 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NANOGQ9H9S0 305 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 STOML1Q9UBI4 398 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PPT2Q9UMR5 302 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 SNX7Q9UNH6 387 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 LAMA1P25391 3075 aa8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TRBC2A0A5B9 178 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 OR6C74A6NCV1 312 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 K7ESF4 209 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 BTN3A3O00478 584 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NVLO15381 856 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ZW10O43264 779 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 MAP3K7O43318 606 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CSF2P04141 144 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 BCKDHBP21953 392 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 HRH2P25021 359 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 HHEXQ03014 270 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 KIR2DS3Q14952 304 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 CPTPQ5TA50 214 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 AAGABQ6PD74 315 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 DLEU7Q6UYE1 221 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 NAGSQ8N159 534 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 METTL4Q8N3J2 472 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 WDR48Q8TAF3 677 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 SLC37A2Q8TED4 501 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 F2RL3Q96RI0 385 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 ECSITQ9BQ95 431 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 MS4A8Q9BY19 250 aa8.43□□□□□ -1.06
SNHG16-202ENST00000493536 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms