RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 URADA6NGE7 173 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NPIPB8E9PQR5 432 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SLC28A1O00337 649 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MANBAO00462 879 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PPP6CO00743 305 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF4O60810 478 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CLEC3AO75596 197 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 THRAP10827 490 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MYF5P13349 255 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN8P19075 237 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ARRB2P32121 409 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CCKBRP32239 447 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CSF2RBP32927 897 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CFHR1Q03591 330 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PWP1Q13610 501 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SMU1Q2TAY7 513 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 UGT3A2Q3SY77 523 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TCTE1Q5JU00 501 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FCRL6Q6DN72 434 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 USP53Q70EK8 1073 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 D2HGDHQ8N465 521 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 USP7Q93009 1102 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NRTNQ99748 197 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CENPKQ9BS16 269 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 NLNQ9BYT8 704 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 EPN3Q9H201 632 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PRORYQ9H606 182 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MRGBPQ9NV56 204 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 AK5Q9Y6K8 562 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 KNTC1P50748 2209 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RGS14O43566 566 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 OR1F1O43749 312 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA6P08185 405 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ST6GAL1P15907 406 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CD22P20273 847 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MPSTP25325 297 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TSFMP43897 325 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 LSSP48449 732 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GYS2P54840 703 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 EMP3P54852 163 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 INHBCP55103 352 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 GFERP55789 205 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 ACY1Q03154 408 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RGS1Q08116 209 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CUL3Q13618 768 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CHSY3Q70JA7 882 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CPLX4Q7Z7G2 160 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-211ENST00000488243 TWIST2Q8WVJ9 160 aa11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms