RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 MZB1Q8WU39 189 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FKBP10Q96AY3 582 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SCYL1Q96KG9 808 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CATSPER2Q96P56 530 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 DRC3Q9H069 523 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 GPRC5BQ9NZH0 403 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PADI2Q9Y2J8 665 aa25.2■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC14BA6NHZ5 514 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FFAR3O14843 346 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR42O15529 346 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFS4O43181 175 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 COL6A2P12110 1019 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ATG9BQ674R7 924 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 COL26A1Q96A83 441 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 POLHQ9Y253 713 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PLAAQ9Y263 795 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SMIM23A6NLE4 172 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 KLK8O60259 260 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SERPIND1P05546 499 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC35G6P0C7Q6 338 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FBLP22087 321 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SETDB1Q15047 1291 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NKG7Q16617 165 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 BORAQ6PGQ7 559 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TBC1D19Q8N5T2 526 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MVB12AQ96EY5 273 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CAPS2Q9BXY5 557 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 OPTCQ9UBM4 332 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ZFP69BQ9UJL9 534 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ATRXP46100 2492 aa25.18■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA8RI6L899 631 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 K7EPI3 171 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TK2O00142 265 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CLGNO14967 610 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ALBP02768 609 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 UMODP07911 640 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 RBP1P09455 135 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 IL1RNP18510 177 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FOLR3P41439 243 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM53BQ14153 422 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NDUFA9Q16795 377 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 AMER3Q8N944 861 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 OR9A4Q8NGU2 314 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2Y1Q8NGV0 311 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SPSB2Q99619 263 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.17■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CD22P20273 847 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 OTX2P32243 289 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 AHRP35869 848 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 DSG2Q14126 1118 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 DOC2AQ14183 400 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 LY6DQ14210 128 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SYT16Q17RD7 645 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 XKR6Q5GH73 641 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SHISA5Q8N114 240 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MED13Q9UHV7 2174 aa25.16■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A1W2PPM1 405 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 UQCRHP07919 91 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SBK3P0C264 359 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM87AP0C7U9 286 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TDRPQ86YL5 185 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CYP4X1Q8N118 509 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TEX9Q8N6V9 391 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 EXD3Q8N9H8 876 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 NT5CQ8TCD5 201 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR54Q9H977 334 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PPCSQ9HAB8 311 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNMB2Q9Y691 235 aa25.15■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms