RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 BDKRB1P46663 353 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MAN2A2P49641 1150 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NR1H2P55055 460 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 WNT3P56703 355 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 DMTNQ08495 405 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FAM53BQ14153 422 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SPARCL1Q14515 664 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NFKBIBQ15653 356 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 HSPB2Q16082 182 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SUSD1Q6UWL2 747 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RANBP10Q6VN20 620 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ADCK2Q7Z695 626 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PLD3Q8IV08 490 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PIP5K1AQ99755 562 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 DEFB126Q9BYW3 111 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 DEPPQ9NTK1 212 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MYO6Q9UM54 1294 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ERVK-11Q9UQG0 969 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PPV9 198 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 IQCF5A8MTL0 148 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 H0YIG0 161 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TXNDC9O14530 226 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CASKO14936 926 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR1I1O60431 355 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ATP6AP2O75787 350 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ANXA9O76027 345 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KRT1P04264 644 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TUBB4AP04350 444 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 APOA4P06727 396 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CYC1P08574 325 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CELA3AP09093 270 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TPH1P17752 444 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 IL1RNP18510 177 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 BCL6P41182 706 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEA5P43359 124 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 HYAL2Q12891 473 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ITIH4Q14624 930 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TRILQ7L0X0 811 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NAXEQ8NCW5 288 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR2M7Q8NG81 312 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 SARAFQ96BY9 339 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 HAUS1Q96CS2 278 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PEX11GQ96HA9 241 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 OR2A5Q96R48 311 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 CCL19Q99731 98 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 MACROD1Q9BQ69 325 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FBXW2Q9UKT8 454 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 NFS1Q9Y697 457 aa6.69□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 A0A087X1B8 175 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 A0A0G2JMM0 328 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PPB8 328 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PRS3 328 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 FEZF1A0PJY2 475 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-222ENST00000449504 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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