RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTL	Q8NG68	377 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7G3	Q8NG95	312 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	REPS1	Q96D71	796 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NXPE2	Q96DL1	559 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDC1	Q9BTX1	674 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SARG	Q9BW04	601 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	HYKK	A2RU49	373 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BQF6	201 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXNDC9	O14530	226 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIAA0754	O94854	1291 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ESRRB	O95718	433 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINE1	P05121	402 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAPN1	P07384	714 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRNG	P07510	517 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF28	P17035	718 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMOX2	P30519	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A2	P31639	672 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP1A2	P50993	1020 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NEK2	P51955	445 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	RGS1	Q08116	209 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT88	Q13099	833 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	STX3	Q13277	289 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	RCN2	Q14257	317 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	RTP5	Q14D33	572 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	METTL6	Q8TCB7	284 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NT5DC2	Q9H857	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402		H0YIV9	168 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	P2RX6	O15547	441 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK17B	O94768	372 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPA4L	O95757	839 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRK2	P25098	689 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC1A6	P48664	564 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	PHEX	P78562	749 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	PWP1	Q13610	501 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	E2F2	Q14209	437 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	THSD1	Q9NS62	852 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.06	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402		H3BMH7	237 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITM2A	O43736	263 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGFB1	P01137	390 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTM2	P28161	218 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINB3	P29508	390 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINB5	P36952	375 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARSF	P54793	590 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf189	Q5VU69	101 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CES4A	Q5XG92	561 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		13.05	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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