RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439561.6

COPB1-202, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPB1, Length 3,382 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-202ENST00000439561 CENPBD1B2RD01 187 aa8.75□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 TAPBPO15533 448 aa8.75□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 GADD45GO95257 159 aa8.75□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 PRAMEF12O95522 483 aa8.75□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 ZNF566Q969W8 418 aa8.75□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 COQ8BQ96D53 544 aa8.75□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 K7ERQ8 282 aa8.74□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 WEE1P30291 646 aa8.74□□□□□ -1.01
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COPB1-202ENST00000439561 ALDH9A1P49189 494 aa8.74□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 SYTL3Q4VX76 610 aa8.74□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 FRG2Q64ET8 278 aa8.74□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 NAGSQ8N159 534 aa8.74□□□□□ -1.01
COPB1-202ENST00000439561 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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