RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED16Q9Y2X0 877 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIVEP1P15822 2718 aa12.41□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2W5A6NFC9 320 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABRR3A8MPY1 467 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA5E9PKD4 350 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFYI3L273 518 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SGK494L7N484 410 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB14O43829 449 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAN1A2O60476 641 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F7P08709 466 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRH2P25021 359 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD96P40200 585 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST13P50502 369 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBPL1P62380 186 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK16Q00536 496 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF470Q6ECI4 717 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK14Q6IE38 97 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEPROQ6NW34 567 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIAH3Q8IW03 269 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A8Q8N695 610 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ9Q92806 393 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MACROD1Q9BQ69 325 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKHQ9HCJ1 492 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPAMQ9HCL2 828 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPIPA1Q9UND3 350 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN3AQ9NY46 2000 aa12.4□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTAGE9A4FU28 777 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH16O75452 317 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR3DL1P43629 444 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFT2D3Q587I9 215 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMC3Q5W041 872 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDSS2Q86YH6 399 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMKVQ8NCB2 501 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THAP11Q96EK4 314 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPAR4Q99677 370 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBCK1Q9BYM8 510 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC68Q9H2F9 335 aa12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVILO75366 819 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEURL1O76050 574 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABOP16442 354 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COILP38432 576 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ1P48048 391 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TERF1P54274 439 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS2R50P59544 299 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-9P60411 292 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSNK1G2P78368 415 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHAGQ02094 409 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP10Q14694 798 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABRAXAS2Q15018 415 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KA1Q15418 735 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASC4Q6P4E1 433 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF549Q6P9A3 640 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYHR1Q6ZMK1 362 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASPGQ86U10 573 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP97Q8IW35 865 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DENND6AQ8IWF6 608 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPNE9Q8IYJ1 553 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGI4Q8N135 537 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GHDCQ8N2G8 530 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HORMAD2Q8N7B1 307 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCT2Q8NC54 265 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLPP5Q8NEB5 264 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD200R1Q8TD46 325 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP11Q8TF27 550 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSLPQ969D9 159 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM4SF19Q96DZ7 209 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf79Q96F83 325 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1F2PQ96R84 312 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR21Q99679 349 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM51Q9BSJ1 452 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SAMD15Q9P1V8 674 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH2B3Q9UQQ2 575 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHRS7Q9Y394 339 aa12.39□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEZF1A0PJY2 475 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF860A6NHJ4 632 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASNA1O43681 348 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SP1P08047 785 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC35G6P0C7Q6 338 aa12.38□□□□□ -0.43
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF24P17028 368 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms