RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 A8MT66 165 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 AGAP14A8MT82 685 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 E5RI56 91 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TNFSF14O43557 240 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CCDC22O60826 627 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SMIM24O75264 130 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TULP3O75386 442 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UGT2B4P06133 528 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SERPINA6P08185 405 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CISD3P0C7P0 127 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF883P0CG24 379 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CCDC166P0CW27 439 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CTPS1P17812 591 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GABRG2P18507 467 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TFEBP19484 476 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LHCGRP22888 699 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLC8A1P32418 973 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HNF1BP35680 557 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RASSF2P50749 326 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NCALDP61601 193 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DLG1Q12959 904 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PTPRCAPQ14761 206 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KRT72Q14CN4 511 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GEN1Q17RS7 908 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ACCSLQ4AC99 568 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CFAP157Q5JU67 520 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CES4AQ5XG92 561 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MACC1Q6ZN28 852 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DPPA4Q7L190 304 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RABEPKQ7Z6M1 372 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PIANPQ8IYJ0 282 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TERB1Q8NA31 727 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CD200R1Q8TD46 325 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UCMAQ8WVF2 138 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 INPP5DQ92835 1189 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1191Q96A73 305 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NXNL1Q96CM4 212 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CNDP1Q96KN2 507 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 BIRC8Q96P09 236 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMEM237Q96Q45 408 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CIPCQ9C0C6 399 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLPBQ9H078 707 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KCNK13Q9HB14 408 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DEC1Q9P2X7 70 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IL36AQ9UHA7 158 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MED16Q9Y2X0 877 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PLXNA2O75051 1894 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 H0YHG0 523 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 QSOX1O00391 747 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FCHO1O14526 889 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 STX16O14662 325 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NPC1O15118 1278 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A2O15244 555 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HDAC3O15379 428 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FLRT2O43155 660 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KLK8O60259 260 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TPBGLP0DKB5 382 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 JUPP14923 745 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 BPIP17213 487 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CALB2P22676 271 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms