RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 BEST3Q8N1M1 668 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ASB11Q8WXH4 323 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KCNJ9Q92806 393 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CYTH2Q99418 400 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KCNK13Q9HB14 408 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MED16Q9Y2X0 877 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 DHRS7Q9Y394 339 aa9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 FEZF1A0PJY2 475 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 FAM227AF5H4B4 570 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 GFYI3L273 518 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 RDH16O75452 317 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 WISP2O76076 250 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 XCR1P46094 333 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CASP6P55212 293 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CSNK1G2P78368 415 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 PTK6Q13882 451 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ACER2Q5QJU3 275 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CD200R1Q8TD46 325 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HES7Q9BYE0 225 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ANKHQ9HCJ1 492 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL1Q9NR64 748 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KLHL42Q9P2K6 505 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SH2B3Q9UQQ2 575 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.76□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MAGEB16A2A368 324 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SDR42E2A6NKP2 422 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TTI1O43156 1089 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SLC19A2O60779 497 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HAUS5O94927 633 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC175P0C221 793 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MLNP12872 115 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 COX6B1P14854 86 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HRH2P25021 359 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 HTR1EP28566 365 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 BCL6P41182 706 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MAGEA6P43360 314 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 AGTR2P50052 363 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TUBA3CQ13748 450 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 EXT1Q16394 746 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 C3AR1Q16581 482 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MEP1AQ16819 746 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ARMC3Q5W041 872 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TTC27Q6P3X3 843 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MTFR2Q6P444 385 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 RPTNQ6XPR3 784 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 ASPGQ86U10 573 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 C17orf64Q86WR6 236 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 KCT2Q8NC54 265 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 PEX11GQ96HA9 241 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 MAGED4Q96JG8 741 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC138Q96M89 665 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 SERPINB12Q96P63 405 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 NDNQ99608 321 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 TINAGQ9UJW2 476 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 FBXO5Q9UKT4 447 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.75□□□□□ -0.85
CLRN3-201ENST00000368671 COMMD10Q9Y6G5 202 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms