RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 SP9P0CG40 484 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CD27P26842 260 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 IER3P46695 156 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TAB1Q15750 504 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ACKR1Q16570 336 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 FUT11Q495W5 492 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR33Q49SQ1 333 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ARMC3Q5W041 872 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD23Q86SG2 305 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CLYBLQ8N0X4 340 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF843Q8N446 348 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TCEANCQ8N8B7 351 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 GDAP1Q8TB36 358 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CORO2AQ92828 525 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 MR1Q95460 341 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PRAC1Q96KF2 57 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf90Q96M02 699 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 NSMCE3Q96MG7 304 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 IL12RB2Q99665 862 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 SHARPINQ9H0F6 387 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 UBQLN3Q9H347 655 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 MRGBPQ9NV56 204 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PANK4Q9NVE7 773 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF186Q9NXI6 227 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 POLKQ9UBT6 870 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CACNG5Q9UF02 275 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 FBXL5Q9UKA1 691 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 NSG2Q9Y328 171 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.54□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM149AA5PLN7 773 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 NR5A2O00482 541 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 BAG3O95817 575 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 GOT1P17174 413 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PRKACGP22612 351 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CTNNA2P26232 953 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC1A3P43003 542 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 OR3A2P47893 321 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 FOLH1Q04609 750 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 GCKRQ14397 625 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM132DQ14C87 1099 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF789Q5FWF6 425 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 XKR3Q5GH77 459 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 MPP7Q5T2T1 576 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRC38Q5VT99 294 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 KIF6Q6ZMV9 814 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 BTN2A1Q7KYR7 527 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 PIGWQ7Z7B1 504 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 LRRTM1Q86UE6 522 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ANKRD46Q86W74 232 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 IQCA1Q86XH1 822 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CREBRFQ8IUR6 639 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ELMOD1Q8N336 334 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 LRTM2Q8N967 370 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF485Q8NCK3 441 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 OR7G3Q8NG95 312 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF519Q8TB69 540 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 OMA1Q96E52 524 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 VMP1Q96GC9 406 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00479Q96M42 142 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 AGAP3Q96P47 875 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.53□□□□□ -2
SNORD3E-201ENST00000362899 ATG101Q9BSB4 218 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms