RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM234Q8WY98 164 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 B4GALT7Q9UBV7 327 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RARRES3Q9UL19 164 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 BMP8BP34820 402 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 UFD1Q92890 307 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC58Q96CX6 371 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TGM7Q96PF1 710 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LGR4Q9BXB1 951 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MBD2Q9UBB5 411 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 VBP1P61758 197 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM198Q66K66 360 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NRROSQ86YC3 692 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LGI4Q8N135 537 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MOAP1Q96BY2 351 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 TPSD1Q9BZJ3 242 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PDE10AQ9Y233 779 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LTN1O94822 1766 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 A0A075B6Q4 140 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 KCNJ13O60928 360 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 BEST1O76090 585 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SYNGR4O95473 234 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MPC1LP0DKB6 136 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MAP3K8P41279 467 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 SLC36A4Q6YBV0 504 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 LNX2Q8N448 690 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 PDPRQ8NCN5 879 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 NR4A3Q92570 626 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 MGME1Q9BQP7 344 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ABCB9Q9NP78 766 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRO-202ENST00000348962 ALDH3A2P51648 485 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DGKQP52824 942 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 RAB2AP61019 212 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ANKFN1Q8N957 763 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FIBINQ8TAL6 211 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 IFT46Q9NQC8 304 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.96□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 MATN2O00339 956 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 OR2B3O76000 313 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 IL33O95760 270 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PGRP06401 933 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PTPRCAPQ14761 206 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PTGESO14684 152 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 STARP49675 285 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 EMX2Q04743 252 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ABHD18Q0P651 414 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 LIPJQ5W064 366 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 EBF4Q9BQW3 602 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 POMPQ9Y244 141 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 C6P13671 934 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CREB1P16220 341 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 ADAM8P78325 824 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 HSF2Q03933 536 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CCDC80Q76M96 950 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SETD6Q8TBK2 473 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM40Q8WWA1 233 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TOX2Q96NM4 488 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 PKP4Q99569 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 COPS4Q9BT78 406 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 LRRC37A3O60309 1634 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FARS2O95363 451 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 OPN1SWP03999 348 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 MATN1P21941 496 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 RABIFP47224 123 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 FAM189A2Q15884 450 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRO-202ENST00000348962 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms