RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637910.1

ARID1B-233, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 2

Gene ARID1B, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-233	ENST00000637910	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TCTE1	Q5JU00	501 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	KDELC1	Q6UW63	502 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SNX20	Q7Z614	316 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	FAR1	Q8WVX9	515 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	C19orf60	Q96EN9	201 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LMF1	Q96S06	567 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LHPP	Q9H008	270 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LUZP4	Q9P127	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	COPG2	Q9UBF2	871 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910		A0A0J9YY10	115 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910		A0A1B0GTL3	188 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910		A0A1B0GX78	115 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	DYTN	A2CJ06	578 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ALG1L2	C9J202	215 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910		F5H423	210 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	BTN3A1	O00481	513 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	PSTPIP1	O43586	416 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SPOP	O43791	374 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	AKR1B10	O60218	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	USP1	O94782	785 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	MLYCD	O95822	493 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	FTH1	P02794	183 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	POLB	P06746	335 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RNF224	P0DH78	156 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ST6GAL1	P15907	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CETN2	P41208	172 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LMAN1	P49257	510 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TAS2R40	P59535	323 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RBPJ	Q06330	500 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CDC16	Q13042	620 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RAPSN	Q13702	412 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LLGL1	Q15334	1064 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	KANK2	Q63ZY3	851 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	DET1	Q7L5Y6	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	KCNMB4	Q86W47	210 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	C1QL4	Q86Z23	238 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	IPMK	Q8NFU5	416 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RNF31	Q96EP0	1072 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	POFUT1	Q9H488	388 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	COG4	Q9H9E3	785 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	OLAH	Q9NV23	265 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CDC23	Q9UJX2	597 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	INTU	Q9ULD6	942 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	PRSS44	E7EML9	344 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CST8	O60676	142 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	KLHL18	O94889	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	APOL3	O95236	402 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	LCA5L	O95447	670 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	AP2A1	O95782	977 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	ONECUT2	O95948	504 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ARID1B-233	ENST00000637910	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms