RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NOXA1	Q86UR1	476 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RAB43	Q86YS6	212 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HID1	Q8IV36	788 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FRS2	Q8WU20	508 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FGF13	Q92913	245 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ASIC4	Q96FT7	647 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ITPA	Q9BY32	194 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DERL2	Q9GZP9	239 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IGFLR1	Q9H665	355 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CDK2AP1	O14519	115 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPR39	O43194	453 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF9	O43307	516 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NIPSNAP2	O75323	286 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UGT2B17	O75795	530 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NFATC1	O95644	943 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IL7	P13232	177 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ARSA	P15289	507 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ALDH4A1	P30038	563 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PIGA	P37287	484 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	UGT2B15	P54855	530 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	HERVK_113	P63132	956 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PIGF	Q07326	219 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RABL3	Q5HYI8	236 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KANK2	Q63ZY3	851 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MICU2	Q8IYU8	434 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	DPP10	Q8N608	796 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FLCN	Q8NFG4	579 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KCNJ9	Q92806	393 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	VPS35	Q96QK1	796 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CIPC	Q9C0C6	399 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	BRD9	Q9H8M2	597 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GALP	Q9UBC7	116 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OR2A25	A4D2G3	310 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659		H3BMM5	538 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	AZIN1	O14977	448 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GGT1	P19440	569 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ETV3	P41162	512 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC15A1	P46059	708 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	IL5RA	Q01344	420 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SEMG2	Q02383	582 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NFATC2	Q13469	925 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OR4D1	Q15615	310 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPR33	Q49SQ1	333 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC66	Q68CR7	880 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPR149	Q86SP6	731 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf40	Q86WS4	652 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	NATD1	Q8N6N6	113 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1191	Q96A73	305 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	PHF21B	Q96EK2	531 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	C3orf30	Q96M34	536 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	APOL5	Q9BWW9	433 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	OBP2A	Q9NY56	170 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GDE1	Q9NZC3	331 aa		14.82	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	EHD3	Q9NZN3	535 aa		14.82	□□□□□ -0.04

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