RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	CPA1	P15085	419 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	MCM3	P25205	808 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PRCP	P42785	496 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP2J2	P51589	502 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SAXO2	Q658L1	398 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SPESP1	Q6UW49	350 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SRL	Q86TD4	932 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM156	Q8N614	296 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LCN9	Q8WX39	176 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	HSFY1	Q96LI6	401 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT12	Q99456	494 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CALHM2	Q9HA72	323 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	BTN3A3	O00478	584 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FFAR3	O14843	346 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CHUK	O15111	745 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR42	O15529	346 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PRSS23	O95084	383 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CP	P00450	1065 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	HLA-DRA	P01903	254 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PPP3CB	P16298	524 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	NDUFS1	P28331	727 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT33B	Q14525	404 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT32	Q14532	448 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CYTH1	Q15438	398 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TTC38	Q5R3I4	469 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	DOK3	Q7L591	496 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	C12orf66	Q96MD2	445 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	RAD18	Q9NS91	495 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CISH	Q9NSE2	258 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	WHRN	Q9P202	907 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FKBP7	Q9Y680	259 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0G2JMM0	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PPB8	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PRS3	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		G3V3Y1	287 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN34	H7C241	214 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		H7C417	338 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061		M0QYV0	167 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PNP	P00491	289 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SFTPB	P07988	381 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LMO1	P25800	156 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC6A12	P48065	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	MAPKAPK2	P49137	400 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	BPIFB4	P59827	614 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	IFT88	Q13099	833 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	GAB1	Q13480	694 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	RCAN2	Q14206	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	DBN1	Q16643	649 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC66	Q68CR7	880 aa		5.66	□□□□□ -1.5

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