RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571473.2

TVP23CP2-201, Transcript of TVP23C pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene TVP23CP2, Length 623 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CP2-201ENST00000571473 TM9SF1O15321 606 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 FFAR2O15552 330 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SIGLEC6O43699 453 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 DUX1O43812 170 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KERAO60938 352 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SDC3O75056 442 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KATNA1O75449 491 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 RFPL1O75677 317 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ZWINTO95229 277 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 C1orf105O95561 183 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SHBGP04278 402 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLC35E2BP0CK96 405 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CD1DP15813 335 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 AMD1P17707 334 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KRT4P19013 534 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TFEBP19484 476 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ACP1P24666 158 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CXCR2P25025 360 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 RPL10P27635 214 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 HPDP32754 393 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CRHR1P34998 444 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CA5AP35218 305 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLCO1A2P46721 670 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CDKN2DP55273 166 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TLE1Q04724 770 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLC18A2Q05940 514 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ABRQ12979 859 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 BMPR2Q13873 1038 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CSHL1Q14406 222 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KIR2DS3Q14952 304 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 NR1D2Q14995 579 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SHBQ15464 509 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ACSBG2Q5FVE4 666 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 GLRX5Q86SX6 157 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TRABD2AQ86V40 505 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 KMT5CQ86Y97 462 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 GPSM1Q86YR5 675 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CEP97Q8IW35 865 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 NAGSQ8N159 534 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EID2Q8N6I1 236 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CCDC63Q8NA47 563 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 LCN9Q8WX39 176 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SMPDL3AQ92484 453 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 APOPT1Q96IL0 206 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SCYL1Q96KG9 808 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 APOLD1Q96LR9 279 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 OLFM1Q99784 485 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EGFL8Q99944 293 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 HAUS8Q9BT25 410 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ABCG4Q9H172 646 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SRMSQ9H3Y6 488 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CAB39LQ9H9S4 337 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 GCM1Q9NP62 436 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PFDN4Q9NQP4 134 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ARL15Q9NXU5 204 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EURLQ9NYK6 297 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PSMD13Q9UNM6 376 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CDYLQ9Y232 598 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 MED16Q9Y2X0 877 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 NFS1Q9Y697 457 aa4.83□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PIPSLA2A3N6 862 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 CPED1A4D0V7 1026 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 TRIM38O00635 465 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 STX16O14662 325 aa4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
TVP23CP2-201ENST00000571473 SUV39H1O43463 412 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms