RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555082.5

PRKCH-211, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCH, Length 2,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-211ENST00000555082 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 PRR23AA6NEV1 266 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 MID1O15344 667 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 MMP20O60882 483 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DIRAS1O95057 198 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 KCNK2O95069 426 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 GABARAPO95166 117 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 CHEK2O96017 543 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 LCKP06239 509 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 GGT1P19440 569 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 CD6P30203 668 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SPAM1P38567 509 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SPINT3P49223 89 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 PPP2R2BQ00005 443 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 VAC14Q08AM6 782 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 CNTN1Q12860 1018 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.6□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 SYTL1Q8IYJ3 562 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 MCFD2Q8NI22 146 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 VMP1Q96GC9 406 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 GPR21Q99679 349 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 CD93Q9NPY3 652 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 RASSF1Q9NS23 344 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 VNN3Q9NY84 501 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 KLHL3Q9UH77 587 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DNAH14Q0VDD8 3507 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 A0A0C4DFX4 3053 aa9.6□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 A0A1W2PPC1 479 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SHISA7A6NL88 538 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 H7C0S8 307 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 PRNPP04156 253 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 VIPR1P32241 457 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DCTP40126 519 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 SERPINB10P48595 397 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 GTF2H3Q13889 308 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 ACOX1Q15067 660 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 ASB2Q96Q27 587 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DSN1Q9H410 356 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 SGO1Q5FBB7 561 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 AADATQ8N5Z0 425 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 FLCNQ8NFG4 579 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 PYCR2Q96C36 320 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRKCH-211ENST00000555082 RMND5AQ9H871 391 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 CD274Q9NZQ7 290 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 A0A1W2PP55 124 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PRKCH-211ENST00000555082 K7ESM1 405 aa9.59□□□□□ -0.87
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