RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539498.1

RAN-209, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAN, Length 1,659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-209	ENST00000539498	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	COG7	P83436	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GRB14	Q14449	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	UBE2S	Q16763	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	AMER3	Q8N944	861 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RAD9A	Q99638	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MGAM	O43451	1857 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498		A0A087X1B8	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RNF103	O00237	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PFKFB2	O60825	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GSR	P00390	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	LCAT	P04180	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FGF2	P09038	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	HOXD10	P28358	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MAGEB1	P43366	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RASSF2	P50749	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	HTD2	P86397	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FOXF2	Q12947	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RABEP1	Q15276	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CTF1	Q16619	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TRPV1	Q8NER1	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ACPT	Q9BZG2	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ABCB11	O95342	1321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	NID2	Q14112	1375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DDHD2	O94830	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GLCE	O94923	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	NDUFB8	O95169	186 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	EPN2	O95208	641 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	ABHD2	P08910	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SLC6A6	P31641	620 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MXI1	P50539	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	NAPA	P54920	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MFAP3	P55082	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MTCP1	P56278	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	DLK1	P80370	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	GPR180	Q86V85	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	CSF3R	Q99062	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAN-209	ENST00000539498	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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