RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532181.5

SSH3-208, Transcript of slingshot protein phosphatase 3, human

TSL 3

Gene SSH3, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSH3-208	ENST00000532181	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	TDRP	Q86YL5	185 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MR1	Q95460	341 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CUTC	Q9NTM9	273 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	XPR1	Q9UBH6	696 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181		A0A1B0GTL3	188 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	HYKK	A2RU49	373 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	FFAR3	O14843	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	GPR42	O15529	346 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KATNA1	O75449	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	STK16	O75716	305 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ONECUT2	O95948	504 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	NUDT17	P0C025	328 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CCND1	P24385	295 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	OR1D4	P47884	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	HNMT	P50135	292 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	EFNA3	P52797	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	REEP5	Q00765	189 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CDC20	Q12834	499 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	HYAL2	Q12891	473 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SETDB1	Q15047	1291 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	GPR135	Q8IZ08	494 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MREG	Q8N565	214 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KCT2	Q8NC54	265 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	STARD8	Q92502	1023 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SARG	Q9BW04	601 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PPP6C	O00743	305 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	MAP3K7	O43318	606 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	OR1F1	O43749	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	COL6A2	P12110	1019 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CREB1	P16220	341 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ALAS2	P22557	587 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SCTR	P47872	440 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CCR8	P51685	355 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	POLE2	P56282	527 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CDC16	Q13042	620 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	IL10RA	Q13651	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	DOC2A	Q14183	400 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	GRM7	Q14831	915 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	RASA2	Q15283	850 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	COLEC12	Q5KU26	742 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	NDC1	Q9BTX1	674 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SSH3-208	ENST00000532181	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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