RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 EXD3Q8N9H8 876 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AVL9Q8NBF6 648 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TEKT4Q8WW24 435 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SCRN2Q96FV2 425 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PEBP4Q96S96 227 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AMACRQ9UHK6 382 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 COX11Q9Y6N1 276 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CENPEQ02224 2701 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TARM1B6A8C7 271 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 DFFAO00273 331 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CES2O00748 559 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SUV39H1O43463 412 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SPRY2O43597 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TMPRSS11DO60235 418 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PGLSO95336 258 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FGF1P05230 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 THRAP10827 490 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ITGB6P18564 788 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ITIH1P19827 911 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LHCGRP22888 699 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MIPP30301 263 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MAN1A1P33908 653 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CYP4F2P78329 520 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GPS1Q13098 491 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TGIF1Q15583 401 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CA9Q16790 459 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PAF1Q8N7H5 531 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CATSPER2Q96P56 530 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LYSMD1Q96S90 227 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 ZPBPQ9BS86 351 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SNX15Q9NRS6 342 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 VPS18Q9P253 973 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PDP2Q9P2J9 529 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 IL17BQ9UHF5 180 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SUFUQ9UMX1 484 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 OR2W5A6NFC9 320 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC53A6NM62 1247 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 B4GAT1O43505 415 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 DUX1O43812 170 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SOD1P00441 154 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PRKCGP05129 697 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 SLC2A4P14672 509 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TNFAIP3P21580 790 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CA4P22748 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CD1CP29017 333 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.349e-6■■■□□ 16.2
PDE4D-222ENST00000514552 ETV5P41161 510 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 MMP13P45452 471 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 GNPDA1P46926 289 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PSG6Q00889 435 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 TRAF2Q12933 501 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 BIRC2Q13490 618 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 FHL3Q13643 280 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-222ENST00000514552 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms