RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497268.1

ZEB2-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 2, human

TSL 3

Gene ZEB2, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB2-223	ENST00000497268	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DIMT1	Q9UNQ2	313 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	UBE4B	O95155	1302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NRCAM	Q92823	1304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		A0A1W2PS29	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		F8W036	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268		H7C0C1	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NR5A2	O00482	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CLOCK	O15516	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SEC14L5	O43304	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TSPAN2	O60636	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DTNB	O60941	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CDH16	O75309	829 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GPX5	O75715	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PDE8B	O95263	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CH25H	O95992	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	IGHE	P01854	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GNAI2	P04899	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MMP2	P08253	660 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	HBQ1	P09105	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	COX5B	P10606	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TNNI3	P19429	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SAT1	P21673	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	HTR1B	P28222	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ABCD3	P28288	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GCH1	P30793	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CASP14	P31944	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NPY2R	P49146	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GNG10	P50151	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NDST2	P52849	883 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NOMO3	P69849	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	REEP5	Q00765	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DAG1	Q14118	895 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NOMO1	Q15155	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	USP37	Q86T82	979 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	FAM228A	Q86W67	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CD101	Q93033	1021 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB2-223	ENST00000497268	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms