RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ENGP17813 658 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 NELFEP18615 380 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 NTSR1P30989 418 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TRIM23P36406 574 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PON2Q15165 354 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 NKG7Q16617 165 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 SDE2Q6IQ49 451 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 COMMD6Q7Z4G1 85 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQU0 124 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 EPN2O95208 641 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 RETP07949 1114 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MTHFRP42898 656 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMEM196Q5HYL7 178 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 GALNT18Q6P9A2 607 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 LCTLQ6UWM7 567 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MTSS1LQ765P7 747 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 HAUS8Q9BT25 410 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 NTN4Q9HB63 628 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 C8orf4Q9NR00 106 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 CLDND1Q9NY35 253 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 F5P12259 2224 aa16.1■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 LATO43561 262 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA1P01009 418 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 DNTTP04053 509 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 FUCA1P04066 466 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 OR52E4Q8NGH9 312 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 UBE2E3Q969T4 207 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ADI1Q9BV57 179 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TAC3Q9UHF0 121 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 IDSP22304 550 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PAX7P23759 505 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PHEXP78562 749 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MERTKQ12866 999 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 LIN52Q52LA3 116 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 IER5LQ5T953 404 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 WDR48Q8TAF3 677 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 TMBIM1Q969X1 311 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.09■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 GPR89AB7ZAQ6 455 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 GNAO1P09471 354 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 GPR89BP0CG08 455 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V1B1P15313 513 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 CYP2A13Q16696 494 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 SERPINA11Q86U17 422 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 C17orf64Q86WR6 236 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 CYGBQ8WWM9 190 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MYOCQ99972 504 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 ZNF639Q9UID6 485 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 WDR37Q9Y2I8 494 aa16.08■□□□□ 0.17
TOM1-216ENST00000492723 UPK1AO00322 258 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 CLPTM1O96005 669 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 ERGP11308 486 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 TEAD1P28347 426 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 PIK3CBP42338 1070 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 KRT78Q8N1N4 520 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 FAM47BQ8NA70 645 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 GABRG3Q99928 467 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 FZD3Q9NPG1 666 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOM1-216ENST00000492723 KCNK6Q9Y257 313 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms