RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 CAPN3P20807 821 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 KRT6CP48668 564 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CLCA4Q14CN2 919 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ATP6AP1Q15904 470 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CYGBQ8WWM9 190 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OR1E3Q8WZA6 343 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC58Q96CX6 371 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GPR174Q9BXC1 333 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ACPTQ9BZG2 426 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SGK2Q9HBY8 427 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 C8orf4Q9NR00 106 aa16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 STK25O00506 426 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 RGS14O43566 566 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SH3BGRLO75368 114 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SEC22BO75396 215 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ATE1O95260 518 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 G6PDP11413 515 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 NPPBP16860 134 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PNLIPRP1P54315 467 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FOXM1Q08050 763 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 COQ5Q5HYK3 327 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 RAD51AP1Q96B01 352 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FBXL20Q96IG2 436 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SNX6Q9UNH7 406 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 INVSQ9Y283 1065 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PCM1Q15154 2024 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CLIC3O95833 236 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FCGR1AP12314 374 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SLC6A2P23975 617 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OXTRP30559 389 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CCR3P51677 355 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 DEFB119Q8N690 84 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TSTD1Q8NFU3 115 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CCL4L1Q8NHW4 92 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ASB12Q8WXK4 309 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CMTM6Q9NX76 183 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.68■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 H3BMQ9 156 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SLC28A1O00337 649 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 IGHV4-34P06331 123 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GPIP06744 558 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 JUPP14923 745 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 IL12AP29459 219 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CCT8P50990 548 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 PMS2P3Q13401 168 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 COG8Q96MW5 612 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 MUC13Q9H3R2 512 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FXYD1O00168 92 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 CLOCKO15516 846 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 EMX2Q04743 252 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 NFATC4Q14934 902 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GGTA1PQ4G0N0 100 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GPR107Q5VW38 600 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 LIPJQ5W064 366 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 FRG2Q64ET8 278 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 SPRED1Q7Z699 444 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRG5Q8IZF4 528 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TRPV3Q8NET8 790 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 GIPC3Q8TF64 312 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 TSPEARQ8WU66 669 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 VPS33AQ96AX1 596 aa16.67■□□□□ 0.26
PRRT4-205ENST00000489835 BIRC7Q96CA5 298 aa16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms