RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	APIP	Q96GX9	242 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	C1orf109	Q9NX04	203 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	POMT2	Q9UKY4	750 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439		A0A0J9YY10	115 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	TGFB1	P01137	390 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	RET	P07949	1114 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALPPL2	P10696	532 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PVR	P15151	417 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	GPX3	P22352	226 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	BCL6	P41182	706 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	GPR3	P46089	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ATP4B	P51164	291 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	DIO3	P55073	304 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CFHR1	Q03591	330 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	BIRC2	Q13490	618 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	NR0B2	Q15466	257 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZIC1	Q15915	447 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	KLHL35	Q6PF15	583 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	RAB33B	Q9H082	229 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	AIG1	Q9NVV5	245 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CTSV	O60911	334 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEC22B	O75396	215 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PNLIP	P16233	465 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAG	P20916	626 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CD1C	P29017	333 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ALDH4A1	P30038	563 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CAPZB	P47756	277 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	RELA	Q04206	551 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	BNIP1	Q12981	228 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	NAA25	Q14CX7	972 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	FCRL1	Q96LA6	429 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	AICDA	Q9GZX7	198 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	OR51B5	Q9H339	312 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	RP1	P56715	2156 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZW10	O43264	779 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	CLEC3A	O75596	197 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	KLHL18	O94889	574 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	PIK3R1	P27986	724 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TBC1D15-208	ENST00000482439	SERPINB1	P30740	379 aa		13.46	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms