RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 VCXQ9H320 206 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 S100A14Q9HCY8 104 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RNF112Q9ULX5 631 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 POMPQ9Y244 141 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KCTD3Q9Y597 815 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.06□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 OR51F1A6NGY5 319 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EFCAB7A8K855 629 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 E5RI56 91 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 AIM2O14862 343 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 AZIN1O14977 448 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KLK8O60259 260 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NUAK1O60285 661 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UGT1A6P19224 532 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ITGALP20701 1170 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UGT1A1P22309 533 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UGT1A4P22310 534 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ME2P23368 584 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MC4RP32245 332 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UGT1A3P35503 534 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SOX11P35716 441 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SESN3P58005 492 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 IL2P60568 153 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KLC1Q07866 573 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LCP2Q13094 533 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 MMEL1Q495T6 779 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 C4orf17Q53FE4 359 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UNC50Q53HI1 259 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 COQ5Q5HYK3 327 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NLRP8Q86W28 1048 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FAM129CQ86XR2 697 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF843Q8N446 348 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FBXO27Q8NI29 283 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NCSTNQ92542 709 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 C19orf60Q96EN9 201 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ZNF570Q96NI8 536 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LYSMD1Q96S90 227 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CMKLR1Q99788 373 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 ALG2Q9H553 416 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 DYTNA2CJ06 578 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 K7ENP7 123 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PEX1O43933 1283 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SUPT3HO75486 399 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CRCPO75575 148 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 THBS1P07996 1170 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PCSK2P16519 638 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TYRP1P17643 537 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 LBPP18428 481 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 FMO4P31512 558 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GPR3P46089 330 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 RGS4P49798 205 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CLCN2P51788 898 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 UCNP55089 124 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 PKNOX1P55347 436 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 GFERP55789 205 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 HHEXQ03014 270 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 CLCQ05315 142 aa6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
MITF-215ENST00000478490 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms