RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 LONRF1Q17RB8 773 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TTLL9Q3SXZ7 439 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZNF766Q5HY98 468 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ACER2Q5QJU3 275 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.37■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SLC19A2O60779 497 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 FGGP02679 453 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MPC1LP0DKB6 136 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 PAMP19021 973 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 IMPA1P29218 277 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 PTGER4P35408 488 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TERF1P54274 439 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 RBPJQ06330 500 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 BTBD16Q32M84 506 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MINDY4Q4G0A6 757 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ARMC3Q5W041 872 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 FCRLBQ6BAA4 426 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 BEST3Q8N1M1 668 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 HIVEP1P15822 2718 aa21.36■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SCN2AQ99250 2005 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZBTB14O43829 449 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MAGEA6P43360 314 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 XCR1P46094 333 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CTBP1Q13363 440 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 PTK6Q13882 451 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MFSD4BQ5TF39 518 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CASC4Q6P4E1 433 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 GDF7Q7Z4P5 450 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ANKRD37Q7Z713 158 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SPC24Q8NBT2 197 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 KCNJ9Q92806 393 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZNF354BQ96LW1 612 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 DHRS7Q9Y394 339 aa21.35■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 C2CD3Q4AC94 2353 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CTAGE9A4FU28 777 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 IL1RNP18510 177 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 HRH2P25021 359 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 BCL6P41182 706 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ADORA2A-AS1P86434 159 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TUBA3CQ13748 450 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 C3AR1Q16581 482 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TUBA3EQ6PEY2 450 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 XKRXQ6PP77 449 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MDS2Q8NDY4 140 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MAIP1Q8WWC4 291 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 NPAS2Q99743 824 aa21.34■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 AKAP9Q99996 3911 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SGK494L7N484 410 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 COX6B1P14854 86 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CD96P40200 585 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ST13P50502 369 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CASP6P55212 293 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 CD200R1Q8TD46 325 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TM4SF19Q96DZ7 209 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 THAP11Q96EK4 314 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 GPR21Q99679 349 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 HES7Q9BYE0 225 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 KCNK13Q9HB14 408 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SAMD15Q9P1V8 674 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 TINAGQ9UJW2 476 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZNF835Q9Y2P0 537 aa21.33■■□□□ 1.01
USP4-208ENST00000464168 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 MAGEB16A2A368 324 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 TTI1O43156 1089 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 KIF5CO60282 957 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 MAN1A2O60476 641 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 VPS41P49754 854 aa21.32■■□□□ 1
USP4-208ENST00000464168 AGTR2P50052 363 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms