RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462122.1

TRAF3IP1-204, Transcript of TRAF3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP1, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DSCR3O14972 297 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 OR1F1O43749 312 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SBK3P0C264 359 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 AGXTP21549 392 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 VARSP26640 1264 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 AHRP35869 848 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 BCL6P41182 706 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CASP2P42575 452 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SCTRP47872 440 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 UCNP55089 124 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 IRF8Q02556 426 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GPS2Q13227 327 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LAPTM5Q13571 262 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 E2F2Q14209 437 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TGIF1Q15583 401 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TBCCQ15814 346 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ST3GAL2Q16842 350 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MUM1Q2TAK8 710 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 XKR6Q5GH73 641 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MANEAQ5SRI9 462 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C16orf46Q6P387 395 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ASPGQ86U10 573 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DSELQ8IZU8 1212 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TEX9Q8N6V9 391 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TRPV3Q8NET8 790 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RDH11Q8TC12 318 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 UBE2E3Q969T4 207 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CCDC126Q96EE4 140 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 WDR34Q96EX3 536 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MVB12AQ96EY5 273 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 APOPT1Q96IL0 206 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SMC6Q96SB8 1091 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 NT5DC2Q9H857 520 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 COPG2Q9UBF2 871 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MID2Q9UJV3 735 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ANKRD12Q6UB98 2062 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SDK2Q58EX2 2172 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PCM1Q15154 2024 aa11.13□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C21orf140B9A014 251 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 E2F3O00716 465 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 NDUFS4O43181 175 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PLIN3O60664 434 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 UGDHO60701 494 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PROCP04070 461 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RPS17P08708 135 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MYZAPP0CAP1 466 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EPORP19235 508 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DCDP81605 110 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TLE3Q04726 772 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RGS1Q08116 209 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CHIT1Q13231 466 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PWP1Q13610 501 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GTF2H2Q13888 395 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DOC2AQ14183 400 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 NDUFA9Q16795 377 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 HKDC1Q2TB90 917 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 BANPQ8N9N5 519 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF740Q8NDX6 193 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MR1Q95460 341 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PGM2Q96G03 612 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GBP5Q96PP8 586 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RUFY1Q96T51 708 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 STARD5Q9NSY2 213 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 WDR70Q9NW82 654 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 KCND3Q9UK17 655 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PCTPQ9UKL6 214 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EMCNQ9ULC0 261 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.12□□□□□ -0.63
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms