RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	DPPA4	Q7L190	304 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	HORMAD1	Q86X24	394 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	NAT16	Q8N8M0	369 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GLYATL1	Q969I3	302 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	C7orf34	Q96L11	122 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	YME1L1	Q96TA2	773 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PKP4	Q99569	1192 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058		E9PQ18	207 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SLC16A8	O95907	504 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CCL5	P13501	91 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CD6	P30203	668 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	FMO3	P31513	532 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	BDKRB1	P46663	353 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	EPHA5	P54756	1037 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF284	Q2VY69	593 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CPTP	Q5TA50	214 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	SLC15A4	Q8N697	577 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	OR7G3	Q8NG95	312 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	COQ8B	Q96D53	544 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TDP1	Q9NUW8	608 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	FZD4	Q9ULV1	537 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		16.34	■□□□□ 0.21
TOM1-210	ENST00000449058	FKBP9	O95302	570 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00271	P0C7V0	271 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF12	P17014	697 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	IDS	P22304	550 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TEAD2	Q15562	447 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZFP90	Q8TF47	636 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	GIPC3	Q8TF64	312 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	APOL4	Q9BPW4	351 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PCM1	Q15154	2024 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	AXIN1	O15169	862 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	GABARAP	O95166	117 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	NUDT7	P0C024	238 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TFPT	P0C1Z6	253 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	MAPK9	P45984	424 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	SPIN4	Q56A73	249 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	REEP1	Q9H902	201 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	DKK3	Q9UBP4	350 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	IL36A	Q9UHA7	158 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		16.33	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	FSHR	P23945	695 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	HPCAL1	P37235	193 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	MMP12	P39900	470 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	KCNJ10	P78508	379 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	IL1RL1	Q01638	556 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	GAB1	Q13480	694 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	RGN	Q15493	299 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	NPTX1	Q15818	432 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	HKDC1	Q2TB90	917 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PITX2	Q99697	317 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	KRT84	Q9NSB2	600 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	AASS	Q9UDR5	926 aa		16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	16.32	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	C9	P02748	559 aa		16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	EPHA2	P29317	976 aa		16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	PCGF2	P35227	344 aa		16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		16.31	■□□□□ 0.2
TOM1-210	ENST00000449058	EPYC	Q99645	322 aa		16.31	■□□□□ 0.2

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