RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ELP6Q0PNE2 266 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL4Q14679 1199 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CARD16Q5EG05 197 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PCID2Q5JVF3 399 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CPZQ66K79 652 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PPTC7Q8NI37 304 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 IFT22Q9H7X7 185 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 FZD10Q9ULW2 581 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 MYLKQ15746 1914 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 VIPP01282 170 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 JCHAINP01591 159 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 STSP08842 583 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SSTR4P31391 388 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX261Q6UWH6 196 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM207Q6UWW9 146 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT1Q86TX2 421 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 ST8SIA4Q92187 359 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 U3KQ87 197 aa8.14□□□□□ -1.11
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM129BQ96TA1 746 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF208Q9H0X6 261 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR83Q9NYM4 423 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.13□□□□□ -1.11
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