RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBC1D10CQ8IV04 446 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEP97Q8IW35 865 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC22A15Q8IZD6 547 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRIML1Q8N9V2 468 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR13J1Q8NGT2 312 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRPC4APQ8TEL6 797 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ROBO4Q8WZ75 1007 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NABP1Q96AH0 204 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPATA17Q96L03 361 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM20AQ96MK3 541 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANKRD27Q96NW4 1050 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RANBP9Q96S59 729 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STACQ99469 402 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM167BQ9BTA0 163 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ULBP2Q9BZM5 246 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLA2Q9H6Q3 261 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC28A3Q9HAS3 691 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMC4Q9NTJ3 1288 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MTMR10Q9NXD2 777 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MPP6Q9NZW5 540 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSPB7Q9UBY9 170 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GJD2Q9UKL4 321 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MTUS1Q9ULD2 1270 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSF4Q9ULV5 492 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MGAT4AQ9UM21 535 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SATB2Q9UPW6 733 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLIC4Q9Y696 253 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CACNG2Q9Y698 323 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CACNA1GO43497 2377 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AQP12BA6NM10 295 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PEX12O00623 359 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATP2A1O14983 1001 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLK10O43240 276 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RTN2O75298 545 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A12O75746 678 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RCBTB2O95199 551 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRAMEF12O95522 483 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 URODP06132 367 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HCKP08631 526 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CNPP09543 421 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADRB3P13945 408 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC15A1P46059 708 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSNK1DP48730 415 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EIF5P55010 431 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAS2R40P59535 323 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACTR2P61160 394 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PAX2Q02962 417 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRMP1Q14194 572 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TAF5Q15542 800 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDKN3Q16667 212 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KYAT1Q16773 422 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PFKFB4Q16877 469 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDR45BQ5MNZ6 344 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC10A5Q5PT55 438 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C6orf136Q5SQH8 315 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HYIQ5T013 277 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BBS12Q6ZW61 710 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NEGR1Q7Z3B1 354 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDK20Q8IZL9 346 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AFAP1Q8N556 730 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR2C3Q8N628 320 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSPYL6Q8N831 410 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BANPQ8N9N5 519 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MDS2Q8NDY4 140 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TBCKQ8TEA7 893 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RUFY2Q8WXA3 655 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PROX1Q92786 737 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C4orf45Q96LM5 186 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM81BQ96LP2 452 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASD1Q96PB1 797 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSD17B14Q9BPX1 270 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 S1PR5Q9H228 398 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EHD1Q9H4M9 534 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MROH8Q9H579 483 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF702PQ9H963 129 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AMBNQ9NP70 447 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OBP2BQ9NPH6 170 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 B3GAT1Q9P2W7 334 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AMACRQ9UHK6 382 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STUB1Q9UNE7 303 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX264Q9Y6I9 313 aa-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms