RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR2T12Q8NG77 320 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC1Q9BTT6 524 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATG10Q9H0Y0 220 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 EBF2Q9HAK2 575 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHST11Q9NPF2 352 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANTXRLA6NF34 631 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC15A5A6NIM6 579 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX28O15482 410 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PEX11AO75192 247 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 BAG3O95817 575 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 GAS8O95995 478 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV4-39P01824 125 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGKAP23743 735 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDC25AP30304 524 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHRNA3P32297 505 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 DUTP33316 252 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FUT6P51993 359 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPCMLQ14982 345 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 WSCD2Q2TBF2 565 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKDD1AQ495B1 522 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX35Q5T0J7 233 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 OLFM4Q6UX06 510 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR88Q6ZMY6 472 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RTN4RL2Q86UN3 420 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCOR2Q8IZ40 523 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 TDHQ8IZJ6 230 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 EID3Q8N140 333 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 THEM5Q8N1Q8 247 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PELI3Q8N2H9 469 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM99Q8N816 258 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CHURC1Q8WUH1 139 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 WBP2Q969T9 261 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ULK4Q96C45 1275 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 HMCESQ96FZ2 354 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 NACAP1Q9BZK3 213 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 DPH5Q9H2P9 285 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 NGBQ9NPG2 151 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTTG2Q9NZH5 202 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR91A4D1P6 747 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PSMD3O43242 534 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRAP2O75791 330 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 IFNB1P01574 187 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FGF5P12034 268 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT5P13647 590 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 GOT1P17174 413 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CA6P23280 308 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CETN2P41208 172 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCG1P45844 678 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 NR2C2P49116 596 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 FMO5P49326 533 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLCN4P51793 760 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRKCEQ02156 737 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNTA1Q13424 505 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 DCAF10Q5QP82 559 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCE4AQ5TA78 99 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAET1GQ6H3X3 334 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCM10Q7L590 875 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 LCA5Q86VQ0 697 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 STHQ8IWL8 128 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELP5Q8TE02 316 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 HAS2Q92819 552 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-272P-201ENST00000411028 RFT1Q96AA3 541 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms