RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FGF11Q92914 225 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MIEF2Q96C03 454 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ULK4Q96C45 1275 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GPR78Q96P69 363 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TRMOQ9BU70 441 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DERL2Q9GZP9 239 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DRC3Q9H069 523 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CDH19Q9H159 772 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ECT2Q9H8V3 914 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MRGBPQ9NV56 204 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SMOXQ9NWM0 555 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SYCE1LA8MT33 242 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYO1CO00159 1063 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PSMD11O00231 422 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KERAO60938 352 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UNC5CO95185 931 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ALPIP09923 528 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SBK3P0C264 359 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CD1DP15813 335 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SAT1P21673 171 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CDKN2DP55273 166 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ST8SIA6P61647 398 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 XIAPP98170 497 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OVGP1Q12889 678 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 BNIP1Q12981 228 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NFATC2Q13469 925 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PEX6Q13608 980 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CSHL1Q14406 222 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 E2F5Q15329 346 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CDKN3Q16667 212 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYLK3Q32MK0 819 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GAGE13Q4V321 117 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LRRC66Q68CR7 880 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZRM9 215 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PIM3Q86V86 326 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NXPE1Q8N323 547 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FITM2Q8N6M3 262 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CHST14Q8NCH0 376 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 VOPP1Q96AW1 172 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SCRN2Q96FV2 425 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FAR2Q96K12 515 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SORT1Q99523 831 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 P2RY12Q9H244 342 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GAREM1Q9H706 876 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SAR1AQ9NR31 198 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DKK3Q9UBP4 350 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MTORP42345 2549 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms