RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZNF839A8K0R7 811 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 EFCAB8A8MWE9 144 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CCL21O00585 134 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TXNDC9O14530 226 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 NDC80O14777 642 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 FFAR3O14843 346 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PFDN6O15212 129 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GPR42O15529 346 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 RAD51CO43502 376 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PRAMEF2O60811 474 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 NIPSNAP2O75323 286 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CCNDBP1O95273 360 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MATN4O95460 622 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 WDPCPO95876 746 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 F10P00742 488 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 COX6B1P14854 86 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 HTR1EP28566 365 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CLCN7P51798 805 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZNF33BQ06732 778 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GARNL3Q5VVW2 1013 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PDIK1LQ8N165 341 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 AMER3Q8N944 861 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CALML6Q8TD86 181 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 KCNJ9Q92806 393 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CCDC120Q96HB5 630 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PWWP2AQ96N64 755 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 DRC3Q9H069 523 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GRHL1Q9NZI5 618 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 WHRNQ9P202 907 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 GALPQ9UBC7 116 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.71□□□□□ -0.53
PRAME-204ENST00000403441 POLQO75417 2590 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 OR5H15A6NDH6 313 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ITGAMP11215 1152 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GABRB3P28472 473 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FMO4P31512 558 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HSD17B2P37059 387 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SLC26A3P40879 764 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ELK3P41970 407 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CA7P43166 264 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 RIPPLY3P57055 190 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CTBP1Q13363 440 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ARHGAP19Q14CB8 494 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HKDC1Q2TB90 917 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MYO7BQ6PIF6 2116 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 NEK10Q6ZWH5 1172 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 METTL21AQ8WXB1 218 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CERS2Q96G23 380 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SLC30A3Q99726 388 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 FBN2P35556 2912 aa11.7□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 C2CD3Q4AC94 2353 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ARHGEF33A8MVX0 844 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MYO1CO00159 1063 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 HAUS5O94927 633 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MLYCDO95822 493 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CATP04040 527 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 CELA2AP08217 269 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 C8orf89P0DMQ9 161 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ERGP11308 486 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 MST1P26927 711 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 ARL4CP56559 192 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 C2orf54Q08AI8 447 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 PCOLCEQ15113 449 aa11.69□□□□□ -0.54
PRAME-204ENST00000403441 NDUFA9Q16795 377 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms