RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 NINJ1Q92982 152 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC30A3Q99726 388 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 DRC3Q9H069 523 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEFB127Q9H1M4 99 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 MMP25Q9NPA2 562 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLSCR2Q9NRY7 297 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 RASSF1Q9NS23 344 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 C14orf105Q9NVL8 296 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANO10Q9NW15 660 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 COQ3Q9NZJ6 369 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAC3Q9UHF0 121 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CBLCQ9ULV8 474 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM166BA8MTA8 275 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4orf51C9J302 202 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NIPSNAP2O75323 286 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANXA9O76027 345 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRTAMO95727 393 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVK-10P10266 1014 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOSL1P15407 271 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD46P15529 392 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP2R1BP30154 601 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 COILP38432 576 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBED6P86452 979 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITIH4Q14624 930 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 POU4F3Q15319 338 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC18A3Q16572 532 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEP1AQ16819 746 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC38Q5VT99 294 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CES4AQ5XG92 561 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 BBS12Q6ZW61 710 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHC2Q8IXK0 858 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCT2Q8NC54 265 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR52K1Q8NGK4 314 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR51Q1Q8NH59 317 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELP5Q8TE02 316 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 RND1Q92730 232 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEX11GQ96HA9 241 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 C18orf12Q96KH6 178 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF354BQ96LW1 612 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA13Q96N96 652 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 OLFM1Q99784 485 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 P2RY12Q9H244 342 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRHDEQ9UKU6 1024 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 FEZF1A0PJY2 475 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM64BA6NI03 449 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 A6NNC1 897 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 A8MUA0 341 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 HACD1B0YJ81 288 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 H7C1Q1 480 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLDN4O14493 209 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 NDC80O14777 642 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PJA2O43164 708 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPOPO43791 374 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEX1O43933 1283 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 APOC2P02655 101 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANXA5P08758 320 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms