RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 NR4A1P22736 598 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CXCR2P25025 360 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PKLRP30613 574 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IGFALSP35858 605 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ALDH9A1P49189 494 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 STC1P52823 247 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FOXA1P55317 472 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K7CLP57077 242 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NCS1P62166 190 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD18Q0P651 414 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCB1Q12824 385 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RAPSNQ13702 412 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GALNT3Q14435 633 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR4D1Q15615 310 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MARC1Q5VT66 337 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 AFMIDQ63HM1 303 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CPZQ66K79 652 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4DQ6B0I6 523 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OSTM1Q86WC4 334 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM69Q86WT6 500 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NETO2Q8NC67 525 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR2T29Q8NH02 315 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1MQ96MI6 270 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PITX2Q99697 317 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BTBD2Q9BX70 525 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM245Q9H330 911 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IL23AQ9NPF7 189 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EHD3Q9NZN3 535 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PCTPQ9UKL6 214 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.97□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HMX3A6NHT5 357 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR6C75A6NL08 312 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WNT9AO14904 365 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PER2O15055 1255 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MUSKO15146 869 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GUCY1B2O75343 617 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SEC22BO75396 215 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RHOBTB1O94844 696 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WDR47O94967 919 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLITRK5O94991 958 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CRYZL1O95825 349 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ND2P03891 347 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CD72P21854 359 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RCVRNP35243 200 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KRT20P35900 424 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TGFBR2P37173 567 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BRCC3P46736 316 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PGGT1BP53609 377 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IST1P53990 364 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GFRA1P56159 465 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MTPNP58546 118 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PON2Q15165 354 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DHCR24Q15392 516 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP7Q16829 419 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TIGD6Q17RP2 521 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 COLEC12Q5KU26 742 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TIGD3Q6B0B8 471 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF280DQ6N043 979 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM171BQ6P995 826 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.96□□□□□ -1.29
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