RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXD1Q9GZZ0 328 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GIMAP2Q9UG22 337 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOTCH2Q04721 2471 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A087WV48 116 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PPW3 197 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLTPD2A6NH11 291 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANXA2P2A6NMY6 339 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 F8VVB4 439 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 F8VWA3 439 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPIPB9F8W1W9 429 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 G3V2L1 256 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMM44O43615 452 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEACAM4O75871 244 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FDPSP14324 419 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYL6BP14649 208 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMA3P25788 255 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SFTPDP35247 375 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CETN2P41208 172 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFAP3P55082 362 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM50BP56557 158 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LMO4P61968 165 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LY6DQ14210 128 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBBP7Q16576 425 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM166AQ6J272 317 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAQR6Q6TCH4 344 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADCK2Q7Z695 626 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLFN11Q7Z7L1 901 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 OCC1Q8TAD7 63 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MGME1Q9BQP7 344 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBXN6Q9BZV1 441 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX25Q9H3E2 840 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKD2L2Q9NZM6 624 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 HACD3Q9P035 362 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK13Q9UKR3 277 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 WIPI2Q9Y4P8 454 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL16Q14005 1332 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC105371242A0A075B767 164 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM86B1E9PN63 330 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ECE2O60344 883 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GBAP04062 536 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 APOA4P06727 396 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPP1P10451 314 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDGFRAP16234 1089 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LBPP18428 481 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPORP19235 508 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 AADACP22760 399 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDHA2P29803 388 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 DSCR10P59022 87 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTENP60484 403 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNK1Q13470 666 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC1A5Q15758 541 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM189A2Q15884 450 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 UGCGQ16739 394 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC27Q6P3X3 843 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOTUMQ6P988 496 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAT1Q6PIZ9 186 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 MOXD1Q6UVY6 613 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTNL8Q6UX41 500 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 C5orf24Q7Z6I8 188 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIGWQ7Z7B1 504 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 TCEANCQ8N8B7 351 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC63Q8NA47 563 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM222BQ8WU58 562 aa2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms