RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346495.6

TSPAN3-202, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,647 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-202ENST00000346495 ASMTP46597 345 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC7A2P52569 658 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PLCL1Q15111 1095 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ADCK2Q7Z695 626 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 GPR156Q8NFN8 814 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 STARD8Q92502 1023 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 JADE3Q92613 823 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TMEM74Q96NL1 305 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 OR51B5Q9H339 312 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CPNE7Q9UBL6 633 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TRBC2A0A5B9 178 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 HOXA6P31267 233 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 S100A3P33764 101 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 GRK3P35626 688 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 C21orf58P58505 322 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DHDDSQ86SQ9 333 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PACS2Q86VP3 889 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 METTL4Q8N3J2 472 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TTLQ8NG68 377 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 NUDT8Q8WV74 236 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 LRRC61Q9BV99 259 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CD320Q9NPF0 282 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 AHSPQ9NZD4 102 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.6■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 FEZF1A0PJY2 475 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 OR1F1O43749 312 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PCDH7O60245 1069 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 C1orf61Q13536 156 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PWP1Q13610 501 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 GPR18Q14330 331 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 KIR2DS3Q14952 304 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SPATS1Q496A3 300 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 COMMD6Q7Z4G1 85 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ARPINQ7Z6K5 226 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 RNF148Q8N7C7 305 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 EGLN2Q96KS0 407 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 OR52E6Q96RD3 313 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 MS4A8Q9BY19 250 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 TWSG1Q9GZX9 223 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 CD300AQ9UGN4 299 aa20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 BTN3A3O00478 584 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SEMA3DO95025 777 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 LRATO95237 230 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 KCNH1O95259 989 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PSMG1O95456 288 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC6A2P23975 617 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 GSTM2P28161 218 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DMWDQ09019 674 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ELOCQ15369 112 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 NAGSQ8N159 534 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 PATE1Q8WXA2 126 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 RMND5AQ9H871 391 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 SNX7Q9UNH6 387 aa20.58■□□□□ 0.89
TSPAN3-202ENST00000346495 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 CYP4F2P78329 520 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 CCDC6Q16204 474 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 PGS1Q32NB8 556 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TSPAN3-202ENST00000346495 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms