RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MERTKQ12866 999 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A3Q9BRY0 314 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL31Q9H511 634 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 EBF2Q9HAK2 575 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQU0 124 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 B4GALT2O60909 372 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GGT5P36269 586 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT7BP56706 349 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2R2BQ00005 443 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 POFUT2Q9Y2G5 429 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX12O00623 359 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PLOD3O60568 738 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OPN1SWP03999 348 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC14L1Q92503 715 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNA7Q96RP8 456 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FBRSQ9HAH7 460 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OARD1Q9Y530 152 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IRS2Q9Y4H2 1338 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 H0YGN5 161 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GNB5O14775 395 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CD1DP15813 335 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ACVR2AP27037 513 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAP31P51572 246 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NFS1Q9Y697 457 aa15.83■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DAPL1A0PJW8 107 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 A8MU76 341 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 H7BY64 318 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD3B1P14060 373 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 HSD3B2P26439 372 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ST3GAL3Q11203 375 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM156Q8N614 296 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 UFD1Q92890 307 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTL8Q9H568 366 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 MKS1Q9NXB0 559 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF4O00268 1085 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL18O94889 574 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RCBTB2O95199 551 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CKMT2P17540 419 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NTSR1P30989 418 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 GNALP38405 381 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ABATP80404 500 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IL18Q14116 193 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SUSD2Q9UGT4 822 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 OAZ3Q9UMX2 235 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SAGE2PA6NJ88 616 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 H6PDO95479 791 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf136Q5SQH8 315 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NR4A3Q92570 626 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DSN1Q9H410 356 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM221BA6H8Z2 402 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC34A8MYJ7 566 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB25P57735 213 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 REEP4Q9H6H4 257 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ING4Q9UNL4 249 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 STATHP02808 62 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 NR2C1P13056 603 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 AGTR2P50052 363 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSWIM3Q96MP5 696 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 PKP4Q99569 1192 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-201ENST00000344528 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms