RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 LDLRP01130 860 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NPPBP16860 134 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 WASHC2DQ5SRD0 308 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 LCTLQ6UWM7 567 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 DERL2Q9GZP9 239 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TSPYL1Q9H0U9 437 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 GPAMQ9HCL2 828 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.32■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 A0A0J9YVX5 310 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 H0YGG7 62 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CDC7O00311 574 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 DSCR3O14972 297 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HIST1H2ADP20671 130 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NAE1Q13564 534 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SLC9A5Q14940 896 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 Q6ZS92 163 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CEP128Q6ZU80 1094 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NACC2Q96BF6 587 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 H2AFJQ9BTM1 129 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CUTCQ9NTM9 273 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ARL15Q9NXU5 204 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NINJ2Q9NZG7 142 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.31■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CREBBPQ92793 2442 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 MASP2O00187 686 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CLDN1O95832 211 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SAT1P21673 171 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SPRP35270 261 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 FAM214AQ32MH5 1076 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 PPM1NQ8N819 430 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ABHD11Q8NFV4 315 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ATL1Q8WXF7 558 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TM9SF4Q92544 642 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 FKBP10Q96AY3 582 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 C10orf90Q96M02 699 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 OR4K3Q96R72 315 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SARGQ9BW04 601 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TRIM54Q9BYV2 358 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SLC26A1Q9H2B4 701 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TXNDC16Q9P2K2 825 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 OARD1Q9Y530 152 aa24.3■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HMX2A2RU54 273 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 H7BY64 318 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 AGPSO00116 658 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 FAM155BO75949 473 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CSNK1G2P78368 415 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 USP10Q14694 798 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.482e-14■■■■■ 52.3
RP9-201ENST00000297157 TTLL10Q6ZVT0 673 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 COX15Q7KZN9 410 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CUZD1Q86UP6 607 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CTAGE3PQ8IX95 158 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 PRAP1Q96NZ9 151 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 LRBAP50851 2863 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 DOCK10Q96BY6 2186 aa24.29■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CACNA1DQ01668 2161 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HYKKA2RU49 373 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HAT1O14929 419 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ALBP02768 609 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 STMN1P16949 149 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TSNQ15631 228 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ZADH2Q8N4Q0 377 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 FMO2Q99518 471 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 HAUS8Q9BT25 410 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ACSS3Q9H6R3 686 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 WDR54Q9H977 334 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 SLC5A6Q9Y289 635 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NTNG1Q9Y2I2 539 aa24.28■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa24.27■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 ANKUB1A6NFN9 424 aa24.27■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RP9-201ENST00000297157 MMP11P24347 488 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms