RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CCSAP-201ENST00000284617 GNB5O14775 395 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RAB36O95755 333 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BDKRB1P46663 353 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf136Q5SQH8 315 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM203Q969S6 136 aa20.52■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ARVCFO00192 962 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HCRTO43612 131 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 COQ9O75208 318 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RBM34P42696 430 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TCEAL6Q6IPX3 200 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC5Q96C12 935 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 COQ8BQ96D53 544 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TCHHQ07283 1943 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 UNCXA6NJT0 531 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFS4O43181 175 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R50P59544 299 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CYBRD1Q53TN4 286 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CHIAQ9BZP6 476 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CNTN5O94779 1100 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 JUNP05412 331 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C7P10643 843 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ADH5P11766 374 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GJA8P48165 433 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CDH11P55287 796 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SYVN1Q86TM6 617 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ARMC10Q8N2F6 343 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC20Q8TCA0 184 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SCLYQ96I15 445 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ITGB1P05556 798 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM15Q13444 863 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP2Q13822 863 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KCT2Q8NC54 265 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FAM46DQ8NEK8 389 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.51■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 J3QRK9 145 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR1I1O60431 355 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA7P01567 189 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CXCR1P25024 350 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MPP2Q14168 576 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 OR8H3Q8N146 312 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL8Q96CD0 374 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 MGAT4BQ9UQ53 548 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SDHDO14521 159 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ATP6AP1Q15904 470 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 EMC10Q5UCC4 262 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC115Q96NT0 180 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 EPYCQ99645 322 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DPAGT1Q9H3H5 408 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NANOGQ9H9S0 305 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 NRG3P56975 720 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 GHRHRQ02643 423 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 KCNC4Q03721 635 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC15Q8TF66 581 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM80Q96HE8 168 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CAPNS2Q96L46 248 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PIK3C2AO00443 1686 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB5O75953 348 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 SCGNO76038 276 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 HK1P19367 917 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PROZP22891 400 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BMP8BP34820 402 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 ATG9BQ674R7 924 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM17Q86X19 198 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.5■□□□□ 0.87
CCSAP-201ENST00000284617 PROKR2Q8NFJ6 384 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms