RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634724.1

QARS-233, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene QARS, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-233	ENST00000634724	ITGAX	P20702	1163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	ALAS2	P22557	587 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	CNTF	P26441	200 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	CCR8	P51685	355 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	SKP1	P63208	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	ERV3-1	Q14264	604 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	C1orf189	Q5VU69	101 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	WDR54	Q9H977	334 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.28	□□□□□ -0.6
QARS-233	ENST00000634724	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	SYCE1L	A8MT33	242 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724		H0YGG7	62 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724		H7BY64	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	HAT1	O14929	419 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	NKX2-8	O15522	239 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ALB	P02768	609 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ABHD2	P08910	425 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CDH1	P12830	882 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CD1D	P15813	335 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	F8A1	P23610	371 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ECHS1	P30084	290 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	RRAD	P55042	308 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	POLE2	P56282	527 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CYP4F2	P78329	520 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CSHL1	Q14406	222 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61	2e-7	■■■■■ 31.4
QARS-233	ENST00000634724	TBR1	Q16650	682 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	DRC3	Q9H069	523 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	EPN3	Q9H201	632 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ACOT9	Q9Y305	439 aa		11.27	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	RFPL1	O75677	317 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	WDR47	O94967	919 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	GNAZ	P19086	355 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CXCR2	P25025	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	MSH2	P43246	934 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	GCGR	P47871	477 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	AVPR1B	P47901	424 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PGGT1B	P53609	377 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PMS2	P54278	862 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	OCA2	Q04671	838 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	SLC9A5	Q14940	896 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	TGFBI	Q15582	683 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	MROH9	Q5TGP6	573 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
QARS-233	ENST00000634724	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.26	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms